W leczeniu skomplikowanych przypadków, wykonujemy endodoncję mikroskopową. Nowoczesne mikroskopy stomatologiczne pozwalają na niezwykle dokładne oczyszczenie kanałów – nawet takich, które trudno wyczyścić normalną metodą np. kanałów zakrzywionych, zarośniętych lub wąskich. Mikroskop zwiększa szanse powodzenia leczenia i może uratować nawet beznadziejny przypadek zęba, skazanego na ekstrakcję. Leczenie kanałowe pod mikroskopem rekomendowane jest we wszystkich trudnych przypadkach, w których chcemy uniknąć zabiegu usunięcia zęba.